
В общем суть такая :
Мой ПК -----Wi-fi-----> Роутер----LAN-----> Сервер MDM -----USB------>Mega2560R3
| |
------------------------------LAN--------------->
Надеюсь понятна схема ;D суть заморачиваться есть только в том что ваша мега перешивается часто и ей нужно находиться далеко от ПК через который вы прошиваете. Тогда это описание решения для нас.
Все очень просто Порт USB меги пробрасывается в сеть на порт нашего MDM, пример если сервер MDM имеет ip 192.168.0.50 то по моей фотке например получится обращение к порту 192.168.0.50:40000 ( можно спокойно это проверить через putty, установить только формат в raw) но! т.к. оболочка arduino работать не умеет с Winsock

на MDM ставим ser2net, настраиваем как на фото (порт можете на свой удобный настроить)
на "Нашем ПК" ставите tibbo virtual serial port и тоже настраивает как на фото (порт и ip MDM указываете свои)
все теперь можете прошивать вашу мегу с своего компа и еще бонус появляется если пробросить порт в интернет....то тогда можно шить и вообще удаленно из любой точки мира 8)
более детально можно почитать и посмотреть http://computer-service.pro/smf/index.php?topic=103.0